２次元電気泳動解析ソフトウェア：PD Quest（Bio-Rad）
設置場所：遺伝子実験施設４階微生物培養室2
機器類利用料（半期）：0円（学内）
２次元電気泳動解析ソフトウェアPD Questは、２次元電気泳動ゲルイメージを読み込むことにより、分子量、等電点、タンパク量などのスポット情報を解析することができるだけでなく、２種類以上の２次元電気泳動ゲルイメージの比較により、得られたスポットの有無や増減、分子量や等電点の変化などの情報を数値化して解析するためのソフトウェアである。スポットの検出からマッチングまでが自動化されており、短時間かつ正確に発現量比較解析が可能である。
また、PD Questは情報管理ツールの機能も充実しており、スポットごとに様々な情報を表示させたり、インターネット上のデータベースにリンクさせたりすることも可能である。
【主な機能】
・Gaussian Fittingによるスポットの自動検出
・最大100枚までの自動マッチング
・複数の方法による染色誤差補正
・特異的スポットの検出
・発現量比較解析
・同一サンプルグループの発現量の平均化
・発現量のヒストグラム表示
・データベースの作成