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TEL. 054-238-4926

〒422-8529 静岡県静岡市駿河区大谷836

静岡大学 グリーン科学技術研究所 研究支援室 ゲノム機能解析部
Functional Genomics Section, Instrumental Research Support Office,  Research Institute of Green Science and Technology

次世代シーケンサー(イルミナGAIIx)

設置場所:遺伝子実験施設 4階 微生物培養室1
機器類利用料(半期):0円(学内

イルミナのケミストリーは、シングルリードとペアエンドライブラリーをサポートする。ペアエンド法で高解像度のゲノムシーケンスを実施できるだけではなく、長鎖インサートのメイトペア法を用いれば、効率よくシーケンスアセンブル、de novoシーケンス、大規模な構造変異の検出が行える次世代シーケンサープラットフォームである。ペアエンドとメイトペアを組み合わせることにより、あらゆるゲノムをの特徴付けが可能となる。この多彩なサンプル調製法により、全ゲノムやターゲットリシーケンス、トランスクプトーム解析、Small RNAの同定、DNAメチル化プロファイリング、全ゲノム網羅的な核酸タンパク質の相互作用解析など、幅広いアプリケーションに対応可能である。


仕様


ラン時間と出力データ

リード長

シングルフローセルラン時間

 データ量
1×35 bp ~2日間 10‐12 Gb
2×50 bp ~5日間 25‐30 Gb
2×75 bp  ~7日間 37.5‐45 Gb 
2×100 bp  ~9.5日間 54-60 Gb
2×150 bp ~14日間 85-95 Gb

クオリティー値

 リード長  Q30以上の塩基割合
 2×50 bp  > 85%
 2×100 bp  > 80%


国立大学法人 静岡大学
遺伝子実験棟
Gene Research laboratory of Shizuoka University

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