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TEL. 054-238-4926

〒422-8529 静岡県静岡市駿河区大谷836

静岡大学 静岡共同利用機器センター ゲノム機能解析部
 Functional Genomics Section, Shizuoka Instrumental Analysis Center

次世代シーケンサー(イルミナMiSeq)

設置場所:遺伝子実験施設 4階 微生物培養室1
機器類利用料(半期):0円(学内

MiSeq は2 x 300 ペアエンドリードと1回のランで最大15 Gbまでのデータを産出できる唯一のデスクトップ型次世代シーケンサーです。これにより、小さいゲノムのアセンブルや、特にホモポリマー領域におけるターゲット変異検出を、比類ない精度で実施します。新たなバージョンの試薬で、今までを上回るリード数をもたらし、さらに多くのサンプル数を短い時間で処理することができるようになりました。デスクトップ型次世代シーケンサーMiSeq なら、最も迅速にサンプルからデータまでのワークフローを実現することができます。



仕様


ラン時間と出力データ
リード長 シングルフローセルラン時間  データ量
V2試薬
1×36 bp 4時間 540-610 Mb
2× 25bp  5.5 時間 750-850 Mb 
2×150 bp  24 時間 4.5-5.1 Gb 
2×250 bp  39 時間 7.5-8.5 Gb 
V3試薬  
2×75 bp  ~24 時間 3.3-3.8 Gb
2×300 bp 65 時間 13.2-15 Gb

クオリティー値

MiSeq v3 試薬キット
2x 75bp の場合、Q30以上の塩基が 85% 以上
2x 300bp の場合、Q30以上の塩基が 70% 以上

MiSeq v2 試薬キット
1x 36bp の場合、Q30以上の塩基が 90% 以上
2x 25bp の場合、Q30以上の塩基が 90% 以上
2x 150bp の場合、Q30以上の塩基が 80% 以上
2x 250bp の場合、Q30以上の塩基が 75% 以上


国立大学法人 静岡大学
遺伝子実験棟
Gene Research laboratory of Shizuoka University

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